IPB

Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )

 Правила этого форума Правила подфорума
 
Ответить в эту темуОткрыть новую тему
> Коэффициент инбридинга, Как его считают, и что он показывает?
Admin.
сообщение 6.2.2009, 17:01
Сообщение #1


Администратор
Group Icon

Группа: Администраторы
Сообщений: 8 174
Регистрация: 10.11.2006
Пользователь №: 2
ПОЛНАЯ кличка собаки по Родословной или название питомника: Афоня (кокер), Кеша(кавалер)
Место жительства (город): Москва



Подсчёт коэффициента инбридинга (по методу Райт).

Легче всего этот метод объяснить на примере.
Родители Фреда в нашем примере, скажем, Дон(АнсонХБесс) и Ева(АнсонХКлара)

Предположим, в этой вязке участвовали полу-брат и полу-сестра, имеющие общего отца (Ансон):
Дон – сын от Ансон и Бесс; Ева – дочь от Ансон и Клары.
Для упрощения, уберём родителей, которые не являются общими: Фред <=ДонХЕва=>Ансон.
Теперь предположим, что некоторый ген, носителем которого является Ансон, имеет две аллели – а1 и а2.
Какая аллель передастся Дону, имеет 50% вероятности передачи Фреду.
Также 50% вероятность, что та же аллель передастся от Ансона к Еве и затем 50% вероятность,
что передастся от Евы Фреду, если Ева будет её иметь. Имея дело с вероятностными событиями,
мы умножаем их значения между собой, в данном случае: 0,5х0,5х0,5=0,125 (12,5%).
Эта цифра показывает вероятность того, что Фред будет гомозиготным по 1 или 2 аллели,
имея общего деда с обеих сторон.
Если это единственный общий предок, то коэффициент инбридинга будет 12,5%.

Метод Райт показывает путь от Фреда к общему предку, Ансону,
и снова обратно по другой стороне родословной: Фред-Дон-Ансон-Ева-Фред.
Считаем количество особей в этой цепочке, исключая Фреда.
Остаётся 3 предка (Дон-Ансон-Ева), это и будет наше значение n=3.
Умножаем Ѕ в нашем случае 3 раза: 1/2х1/2х1/2=1/8, что равно 12,5%, как мы уже подсчитали выше.

Теперь представим, что общий предок был прадедушкой в этом помёте.
Это добавит по ещё одной особи к нашей цепочке с каждой стороны:
Фред-Х-Дон-Ансон-Ева-У-Фред (n=5), и потому инбридинг на Ансона будет Ѕ в 5 степени, или 1/32 (=3,123%)

Сложности.
Если бы у нас всегда был только один общий предок, жизнь была бы довольно простой.
Однако, есть несколько сложностей, которые надо принимать в расчёт.
Первое – это то, когда у нас больше одного общего предка.
Например, возьмём пару из двоюродных родственников.
Мы уже подсчитали коэффициент для единственного общего дедушки.
Если же бабушка и дедушка общие, то мы просто сложим полученные коэффициенты, и получим 6,25%.

Следующая сложность – это то, что наш общий предок может быть инбредным.
Если это так, то его или её коэффициент инбридинга мы тоже подсчитаем.
Чтобы его учесть, мы умножим наш полученный для Фреда коэффициент на (1+Fa),
где Fa – коэффициент инбридинга, полученный для Ансона.
Например, если Ансон получен в результате вязки двух полных двоюродных родственников,
то полный коэффициент инбридинга для Фреда будет 0,125х1,625=0,133(13,3%),
ЕСЛИ только нет других общих предков с обеих сторон.

К сожалению, в некоторых родословных можно найти большое количество общих предков.
Для таких родословных очень трудно подсчитать коэффициент инбридинга вручную,
но существуют специальные программы.

Подсчёт инбридинга только для первой пары поколений не слишком показательно.
Когда у нас есть больше одного общего предка в 4-5 поколениях,
то получается коэффициент инбридинга, как правило, больше желаемого.

К сожалению, даже если в 4-5 поколениях не было общих предков, то и в этом случае нет гарантии,
что был их переизбыток где-то ещё раньше,
и поэтому получится средне- высокий коэффициент инбридинга даже в таких родословных.
В идеале для подсчёта следует использовать 10 поколений предков.
Но если использовать меньше 6 поколений – то подсчёт не будет надёжным
Пользователь в офлайнеКарточка пользователяОтправить личное сообщение
Вернуться в начало страницы
+Ответить с цитированием данного сообщения
swarta
сообщение 6.2.2009, 17:52
Сообщение #2


Гуру
Group Icon

Группа: Заблокированные
Сообщений: 441
Регистрация: 1.10.2007
Пользователь №: 1 699
ПОЛНАЯ кличка собаки по Родословной или название питомника: BrightLight of Moscow
Место жительства (город): Москва



На этой странице есть таблица коэффициента Райта, и вообще много интересной информации, для тех кто хочет в этом разобраться (если кому-то подсчет КР поможет вывести достойную особь smile.gif )
http://nata-05p.narod.ru/genetika.html
Пользователь в офлайнеКарточка пользователяОтправить личное сообщение
Вернуться в начало страницы
+Ответить с цитированием данного сообщения
Alph
сообщение 6.2.2009, 18:46
Сообщение #3


Великий Гуру
*********

Группа: Пользователи
Сообщений: 4 005
Регистрация: 20.11.2006
Из: Fedorovka.Russia.
Пользователь №: 8
ПОЛНАЯ кличка собаки по Родословной или название питомника: "ANGELGIN"



ужас.... я умом понимаю, что знать все это необходимо, но когда начинаю влезать в эти "дебри"..... чую, что у меня не то образование sad.gif либо язык для меня очень непривычный, никак не могу его понять.
... короче, сделала один вывод, без кандидатской диссертации ( как минимум) в разведении делать нечего unsure.gif
где там "золотое сечение"? какой коэффициент можно считать самым "тем"? понятно, что все очень индивидуально.
Но где та грань ( по коэффициенту) за которую переходить уже чревато... да и ваще... что то в голове у меня все перемешалось- вопросы с другими вопросами... пойду думать

Сообщение отредактировал Alph - 6.2.2009, 18:49
Пользователь в офлайнеКарточка пользователяОтправить личное сообщение
Вернуться в начало страницы
+Ответить с цитированием данного сообщения
daria
сообщение 8.2.2009, 13:03
Сообщение #4


Великий гуру
********

Группа: Пользователи
Сообщений: 1 406
Регистрация: 20.5.2007
Из: Черноголовка, МО
Пользователь №: 408
ПОЛНАЯ кличка собаки по Родословной или название питомника: Happium



Цитата
На этой странице есть таблица коэффициента Райта, и вообще много интересной информации, для тех кто хочет в этом разобраться (если кому-то подсчет КР поможет вывести достойную особь )

Теорию лучше знать, особенно по началу smile.gif Это с опытом появляется что-то, на что еще можно ориентироваться. А в начале пути знания лишними не бывают и могут уберечь от ошибок.
Кать, я тему инбридинга не очень хорошо знаю, но лично считаю, что нельзя сильно им увлекаться, пока сама не уверена хотя бы на 90% в тех особях, на кого инбредируешь (ведь с закреплением типа, могут вылезти и какие-то "скрытые" заболевания). Подчеркиваю, что я теоретик-почтисамоучка. И с удовольствием выслушаю доводы против моего мнения. "Я не волшебник, я только учусь".
Но вот финский пинчер-клуб имеет следующие требования к пометам:
Цитата
max 6,25% by 5 generations and not exceeding 10% by 8 generations

То есть они заведомо ограничивают близкородственные вязки.

Сообщение отредактировал daria - 8.2.2009, 13:06
Пользователь в офлайнеКарточка пользователяОтправить личное сообщение
Вернуться в начало страницы
+Ответить с цитированием данного сообщения
Admin.
сообщение 27.5.2009, 14:01
Сообщение #5


Администратор
Group Icon

Группа: Администраторы
Сообщений: 8 174
Регистрация: 10.11.2006
Пользователь №: 2
ПОЛНАЯ кличка собаки по Родословной или название питомника: Афоня (кокер), Кеша(кавалер)
Место жительства (город): Москва



На сайте питомника Lazycroft всегда пишут коэффициент инбридинга для всех помётов (даже если он 0,0)
И ещё какой-то Skk - это что ? rolleyes.gif

По этой ссылке довольно понятно представлена СХЕМА ИНБРИДИНГА
Пользователь в офлайнеКарточка пользователяОтправить личное сообщение
Вернуться в начало страницы
+Ответить с цитированием данного сообщения

Ответить в эту темуОткрыть новую тему
1 чел. читают эту тему (гостей: 1, скрытых пользователей: 0)
Пользователей: 0

 



Текстовая версия Сейчас: 15.12.2019, 0:48